Niazov werd op 27 oktober 1990 tot president van Turkmenistan gekozen en Niazov transformeerde van communist tot nationalist. Op 27 oktober 1991 verklaarde Turkmenistan zich onafhankelijk, wat op 8 december 1991 door Moskou werd erkend.
In 1992 schafte Niazov de TCP af en verving haar door de Democratische Partij van Turkmenistan (DPT). Daarnaast schafte hij het ambt van premier af en begon hij als autocraat te regeren. Oppositieleiders werden al in een vroeg stadium na de onafhankelijkheid gevangengezet en de pers werd gecensureerd. In 1993 schonk Niazov zich de titel Turkmenbashi ('Leider der Turkmenen').
Niazov introduceerde allerlei buitenissige zaken in Turkmenistan.