Een van de grote problemen is nog steeds de influx van Vietnamezen die in Cambodja komen wonen. Ook de Khmer Krom vormen een politiek probleem voor de regering. Er heerst in Cambodja dan ook een sterk anti-Vietnamees sentiment. Ook de Thais worden beschouwd als kolonisator en de woede hierom is door politieke figuren gebruikt om in januari 2003 een grote onrust tegen Thaise bedrijven en instellingen uit te lokken. Onder andere de Thaise ambassade is toen afgebrand.

De grote politieke rivaliteit tussen de partijen van Hun Sen, prins Norodom Ranariddh (gesteund door koning Norodom Sihanouk) en Sam Rainsy in combinatie met de overvloedige beschikbaarheid van oorlogstuig vormen een gevaar voor de stabiliteit van het land.
Tevens heerst er corruptie. Zo steekt een kring rond de corrupte regering een miljoenenopbrengst uit de massale houtkap in eigen zak. Cambodjanen die daar tegen in opstand komen riskeren hun leven.
De schrijnende armoede die van dat alles het gevolg is, tesamen met de talloze landmijnen en de gevolgen daarvan vormen op het platteland een groot probleem.